Atualmente, a Tam Mercosur oferece vôos a partir de Assunção para Ciudad del Este (Paraguai), Buenos Aires (Argentina), Montevidéu (Uruguai), Sta. Cruz de la Sierra e Cochabamba (Bolivia), Santiago (Chile), São Paulo e Rio de Janeiro. Na alta temporada, também realiza vôos especiais para Florianópolis, Punta del Este e outras cidades do continente sul-americano.

Em julho, a companhia iniciou também duas freqüências diárias ligando o aeroporto do Galeão, no Rio de Janeiro, às cidades de Assunção e Buenos Aires. A Tam Mercosur ainda mantém acordos de code-share com a Aerolíneas Argentinas (vôos para Buenos Aires), Lan (Iquique e Santiago), Pluna (Montevidéu), Grupo Taca e Iberia.